制等问题，做了精心周密的部署和安排。为保证打捞工作的安全，海军部署东海舰队所属舰艇部队负责海上作业区的巡逻警戒，组织海军舰艇部队对沉船海域进行反复的扫海和探测，对沉船进行了精确的定位。海军还决定，每年从海军北海、东海、南海舰队中抽调120名潜水员、20名潜水军医、10名工程技术人员，抵平潭岛作业船队进行轮流作业。海军还组成专门工作组，对平潭岛和牛山海域进行了现场调研，与福州军区商定了有关兵力指挥等一系列问题，切实做到稳妥可靠，万无一失。
1977年5月初，由海军J101号、J503号打捞船，交通部上海救捞局沪救3号打捞船组成的打捞作业船队正式进驻牛山岛以东作业海域，交通部与海军共同成立了打捞作业现场指挥部，统一实施对打捞作业的指挥，双方还进行分段打捞分工。海军派出的舰艇巡逻编队随即也抵达了作业区现场，并展开了对作业区的巡逻警戒。有关部门对外发布消息和航行警告，宣布在牛山海域打捞阿波丸沉船。
这一消息惊动了世界，因为许多国家认为中国根本没有能力进行打捞阿波丸，但中国人有信心有志气，实践证明，不仅圆满完成了打捞阿波丸的任务，而且实际作业时间比花旗国计划的所需有效工作日还少。打捞阿波丸沉船开始后，先是清理缠在沉船上的鱼网，仅清理出来的鱼网就有2吨多重，这个庞然大物长期躺在海底，对过往拖网渔船生产作业带来了严重危害。然后。进行了淤泥清除，共除泥12291.5立方米。
打捞的进展和结果，每天晚上20时由海军东海舰队作战值班室上报海军作战值班室，由海军作战值班室报上级作战值班室，逐级上报到最高机关。海军将打捞阿波丸工作作为大事来抓，有关涉及到打捞阿波丸的兵力组织和巡逻警戒等工作都由海司作战部负责，作战值班员在每日的作战交班时，将打捞阿波丸的情况专项向参加交接班的海军、海司首长汇报。
参加打捞工程的海军官兵和救捞局职工勇闯潜水禁区，取得了令人鼓舞的成绩，海军J101号，J503号船，上海救捞局沪救3号船，共有600多名潜水员参加了水下作业，各船平均作业332天，共潜水3604人次，水下切割2379.1平方米，水下爆破650次，捞起锡锭、橡胶、水银、铌钽、云母、光化玻璃等物资共5418吨，总价值5000多万元人民币。另外还打捞起日国人的尸骨368具，由中国上海市红十字会交还给日国红十字会。
不过在这次打捞作业中，
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