.作为日本联合舰队的诞生地和一大母港，佐世保军港扼守着马海峡的南出口，地理位置十分重要。这座军港四周被群山环绕着，进口航道的西面有五岛列岛作为屏障，加上港内众多深水泊位，因而又是一个天然的良港。德俄战争爆发之时，日本第一舰队主力正驻泊在这个军港内。
或许是佐世保的闪耀吸引了太多目光，以至于很少有人去关注那位于九州地区最西端、地理上为佐世保担当屏障的五岛列岛。虽然名为“五岛列岛”，但实际上光拥有居民的岛屿就有7、8个，另外还有包括鸟岛、男女群岛在内的众多鲜有人烟的岛屿。作为战国时代五岛氏的根据地、德川家康开创幕府时代之后的五岛藩以及丰臣秀吉侵朝期间的前哨站，五岛列岛虽小，却一直是战略上的要地。日俄战争之后，日本海军陆续在这里修建了一系列警戒观测基地，而随着潜艇这一武器出现在日本海军的作战序列中，五岛列岛的某些无人岛屿上又建立起了秘密的潜艇基地。这些潜艇近可封锁对马海峡，稍远可前往朝鲜半岛沿海活动，只要是航海性能尚可的均可以在中国的黄海、东海海域活动。
1928年2月，距离德俄战争爆发尚有半年多的时候，德俄两国之间边境摩擦不断，有识之士并未将这种摩擦当作平常的小纠纷，看到德国自1927年以来保持着100万常备军、300万准常备军的“带薪预备兵”以及200万非洲殖民军，俄国也在悄悄做着战争准备。就在这样的背景下，在被五岛列岛当地居民称作“石岛”的一个孤岛上，一座由日本海军所有、俄国海军租用的秘密潜艇基地落成了。
作为“俄日互助密约”的项目之一，石岛潜艇基地的建设总共征用了8千余多印度人、约2千马来西亚人和3千多名澳大利亚战俘，在岛南侧开凿出一个可容纳50艘潜艇和数千官兵常驻的潜艇隐蔽所，如此浩大的工程竟在短短4个月内完工，工程强度之大、劳动力损失之高放眼整个世界都颇为罕见，在工程验收之后。这些被强征来地劳工便凭空消失了一般再无音讯，倒是石岛附近的一种海鱼数量突然暴增，个中缘由就不难猜测了。
到4月初的时候，石岛潜艇基地已经进驻了32艘隶属于俄国太平洋舰队的潜艇，其中约有一半是从海参威军港调来的，还有一半则是由俄国水兵直接到基地来接收的——在日俄战争之后，论造船技术和实力，日本都远在俄国之上。出于某些共同的目的，在1925年之后，日本一共向俄国出售了79艘舰艇，其中三分之一是排水量700到1050吨地潜艇，据说
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