在回到璃月港，经过灵智与钟离的确认后，层岩巨渊的给他的异常感已经消失，这件的事情算是稍微告了一段落。
灵智也稍微捋了一下事情时间线。
最开始是层岩巨渊发生了异常，导致矿洞频繁发生事故，所以七星封锁了那里。
然后深渊教团发现了层岩巨渊的异常，来到了这里，开始研究那座古遗迹里的池水。
在研究取得了一定进展后，他们使用了深渊的力量，屏蔽了天理那边对于层岩巨渊的感知。
如果不是佐助的到来，产生了灵智这一具有着‘世界之外’力量影响的分身，然后让佐助介入，可能深渊教团真的会把层岩巨渊底下的那座古文明当做据点。
毕竟那里有着源源不断的黑泥。
而黑泥已经开始对钉子产生一定程度的影响，后面会发生什么，真的难以预料。
毕竟层岩巨渊这个地方比较特殊，这里曾经爆发过漆黑战争。
不过所幸，因为佐助，这个大麻烦在产生前，就得到了解决。
接下去的几天，佐助原本是应该为前往稻妻做准备的。
这跟钟离的话有关，也跟自己每次都被误认为这个世界的稻妻人有关。
但是忍者世界那边突然发生的事情，却不得不让他的这个计划暂时中断。
……
另一个时空的木叶。
大筒木一族的大筒木浦式因为对付不了已经完全体的漩涡鸣人，所以打算使用大筒木一族的黑科技忍具时间机器回到过去的木叶，抓捕九尾。
在使用调虎离山之计将木叶的精英力量骗出木叶以后，大筒木浦式出现在木叶的展览馆——之前大筒木的时间机器被打成普通文物挖掘出来保管在这个展览馆内。
而漩涡博人通过一系列线索反向思考，破解出了大筒木浦式的真实目的与自己的师傅宇智波佐助（后面为了区分，成年的佐助简称叔佐）一起折返村中，在展览馆发现了已经打开时间隧道的浦式。
为了追捕大筒木浦式，叔佐，博人，一起进入了由浦式使用时间机器打开的时间隧道。
在因为在时间隧道中产生的打斗，在战斗中，博人脑袋磕到一下时间机器并因此不慎掉入隧道外。
时空隧道似乎也因为博人的这一记超级头槌产生了一些变化，变为了时空乱流。
在这千钧一发之际，叔佐使用天手力将浦式与博人的位置交换，让博人从时空乱流之中逃脱，而被卷入乱
…。。