安时代末期，天下的纲纪开始大乱之后，这些僧寺地主开始组织僧兵来保卫自己、并且争夺利益。
因为有宗教信仰的洗脑，所以僧兵大多数悍不畏死，再加上财富众多，所以一些僧寺就成为了强大的武力集团，在平安时代的末期，兴福寺、延历寺、东大寺等等僧院，就成为了这样的武力集团，和一般的军阀相比都不遑多让。
而到了天下更加大乱的战国时代，社会矛盾更加激化，僧寺势力也得到了更大的膨胀。以本愿寺为核心的一向宗势力，通过煽动信徒暴乱，谋求建立********的‘佛国’。在动了多次暴乱之后，一向宗成为了最庞大的寺社势力，统治着大片土地。
寺社势力的膨胀，很快就惹来了世俗界强人的忌惮，战国时代崛起的强人织田信长，开始谋求限制这些寺社的势力、剥夺他们的武装力量，很快就和一向宗产生了武力冲突。
在石山合战当中，本愿寺和盟友朝仓氏一起和织田信长决战，但是最后败于织田信长，一向宗也由此受到了绝大打击，各地的暴乱也随之戛然而止。
在织田信长的野心下，其他寺社也遭遇了同样的打击，其中历史悠久、占有莫大财富而且在佛门地位极高的延历寺，也因为屡屡不听从他的命令，而成为了他打击的重点目标。
他下令纵兵前往延历寺的本山比叡山，声言要把这座宗教圣山夷为平地。
在他的命令下，他的部下封锁一切下山通路，然后纵起大火，对延历寺开始了残酷的围歼战。传言本愿寺的根本中堂以下山王二十一社全被焚毁，包括僧侣、信徒在内约三四千人，不分男女老幼，均惨遭屠杀。
火烧比叡山因此信长这一行为为众多寺社怨恨，并且送予他“第六天魔王”的称号。大家都传说织田信长是因为信仰了南蛮传过来的洋教，所以才做下了这些疯狂之举——虽然其实信长并不是因为宗教信仰的缘故而做出这些行为的。
在织田信长死后，丰臣秀吉以及后来的德川家康相继统治日本，他们对寺社势力的做法不再那么激进，但是暗地里还是以限制为主。
在持续三代人的打击之下，原本庞大的寺社势力开始烟消云散，寺社的土地和财富大部分落入到了幕府和各地的藩主之手。本愿寺则在德川家康的支持之下，出现了大分裂，再也无法对幕府的统治构成威胁。
由此也可以预想得到，原本的寺社势力应该也是对幕府十分不满。如果大汉打出一个消灭洋教，协助日本恢复信仰的纯洁，并且保证愿意让寺社恢
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