朝鲜义军、僧兵蠢蠢欲动，日军方面当然也不是在闲着睡大觉。此时在清州城内的日军守将为蜂须贺家政，其所部正镇守于清州至忠州之间的大小城镇，兵力可谓相当分散，其在清州城内居然仅有三百余人。
危险吗？看起来很危险，不过这其实也要看大局，毕竟日军自登陆以来，朝鲜军往往一触即溃，日军根本未遇敌手。正是在这样的大局之下，蜂须贺家政由此对朝鲜战力不屑一顾，虽然身边仅留数百士兵，他也认为足以压制清州，并威慑周边。
这月初一，赵宪所部一千一百人，灵圭僧兵七百人，官军五百，合计两千三百余人进抵清州。由于此前赵宪已经定下计谋，因此便先令本部出五百人诱敌出城，剩余六百义军与七百僧兵于两侧埋伏等待号令，官军负责追击败军。应该说，这是一个极其常见的诱敌围歼计。
蜂须贺家政见清州城外的挑衅者全是寻常百姓，一个个身无片甲，手持粗制刀枪，甚至许多人不过是拿着锄头、草叉、柴斧等农具，同时他们还队列散乱，只知道在火绳枪射程之外叫骂。
蜂须贺家政冷笑连连，对手下人道：“区区数百贱民，手持农具，连足轻也称不上，哪来的胆量敢在城外叫骂，必须全部碎尸万段，以儆效尤！”他不是说说而已，立刻下令以一百兵卒追杀此股义军。
义军见一百余名日军攻来，便与之厮杀。显然，义军虽有五百之众，但衣甲兵械毕竟不如日军精良，加上又是无阵型乱斗，激战不过一刻便有近三百名义军伤亡，战局可谓一边倒。
赵宪见状忙发信号，前部后退引日军追击，随后两侧伏兵突起，瞬间便将日军合围。这一下兵力优势太大，日军无法突围，全部被义军及僧兵斩杀。不过义军缴获火绳枪却不会使用，只得先当做冷兵器随身携带。
蜂须贺家政于城楼望见敌有伏兵，不禁吃惊，细数下来惊觉敌军竟有数千之众，由于此刻城内守兵仅剩两百，蜂须贺家政心中无底，难免有所慌乱。
赵宪及灵圭趁势号令僧兵、义军全力攻城，义军士气高涨，呼喊响彻清州，于城下与日军鏖战。此刻忽然乌云密布，天降倾盆大雨，日军火绳枪虽然制作精度不错，但技术水平却不算高，可比不得明军前些年换装的万历二式那样拥有一定防雨水能力，因此陡然之间全部失效。不过祸兮福所倚，朝鲜方面也因大雨浇灌而无力攻城，赵宪无奈之下也只能下令撤围。
蜂须贺家政见天降大雨，急忙跪地感谢神明护佑，但同时心知，次日一旦天晴，义军必再攻城
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