领区驻防忍军、涡之国留守部队、雾隐义从、雨忍村征召忍者、联合公司雇佣忍者等；就连木叶也有警务巡逻部队、常备纵队和预备纵队等。
再加上如今投降的云隐、岩隐忍者及其忍军建制，风之国砂隐忍者的各部忍军……五花八门叠加起来足以令人眼花缭乱。
所以为了统一军权，宇智波德光必须对各部忍军进行完全整编。同时，他还要确立的就是‘军政分离’原则，也就是忍军从此不再干涉地方政务，而这也是他之所以委任那些强者出任地方政务官的原因之一。
除此之外，所有的忍军亦将由宇智波王朝之大皇帝也就是宇智波德光及其直系继承人直接统领，将其与忍界政府完全分割开来。
第一个完全裁撤的是四大边境防御部队的名号，由于忍界一统，自然也不再需要所谓的边境防务，于是原边境防御部队合并为王朝陆军防卫第一军，下辖八个联队，每个联队下辖一千名忍者，但由于忍界初定，所以这些陆军联队只是更换了名号，就连军事长官也暂未任命，当前仍然驻留原地，将配合内务部队打击叛乱分子等。
而木叶常备纵队、预备纵队的在册忍军统一整编为王朝陆军防卫第二军，下辖五个联队五千名忍者，并由宇智波长景出任首任总大将。
宇智波长景乃是暗卫队长出身，又有边境防御部队指挥、幕府侍卫长的履历，由他掌握木叶忍村的常备部队，宇智波德光也更加放心。
而联合反恐部队则就地改编为王朝陆军战略支援部队，并将西北镇守府的余部合并了进来，整编为七个联队七千余名忍者，仍然由宇智波椎名担任总大将。
而伏波城的海军舰队和雾隐忍者则统编为王朝海军总部，下辖三个海军舰队以及四个海军特遣陆战旅，他们将是宇智波德光开拓新世界的基石。
砂隐方面，原有的八千余名砂隐忍者抽选四千人组成王朝陆军防务第三军，由罗砂的死对头叶仓出任总大将，其余的砂隐忍者则分流到联合公司或作为预备役存在，也算是给他们一个不错的出路了。
罗砂对此自然也没有意见，毕竟军政分离嘛，以后和叶仓老死不相往来就是；所以他在令人将一尾送到伏波城之后，便也愉快地返回西南政务大区当他的首席政务官了。
至于那些战败投降或被俘的云隐、岩隐忍者，宇智波德光暂时对他们并不怎么信任，所以只是简单地将其统编为二十二个屯垦联队并控制起来，但既没有发放新式忍具，也没有委任上级指挥人员，而他们的作用将是未来
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