芝龙集结了两万五千兵力，率领将士在金门“祭天”“礼地”“祭江”，举行隆重的誓师仪式。一切准备就绪后，船舰将士集结于料罗湾，候风进发。
九月初七，郑芝龙的船队越过台湾海峡，陆续到达了澎湖列岛。他第一时间派人向荷兰总督普特斯曼发出了警告。一天之内把吴又可送回来，否则立刻攻城！
普特斯曼见郑芝龙来势汹汹，也有些慌了。
就抓了个大夫，你们至于么？
两万多人，四百多条战船？
但从这就更能看出吴又可的重要性，想到这，他脑子一热，做出了一个自杀式的决定。他命人把吴又可送到了普罗民遮城，也就是后来的赤坎城。
而他决定死守奥伦治城！
他认为，只要奥伦治城不沦陷，普罗民遮城就最安全。同时他又给罗三炮下了命令，无论用什么手段，都要从吴又可的嘴里撬出治疗疟疾特效药的药方！
一天过去了，郑芝龙没有等到普罗斯曼的回复，毅然下达了进攻的命令。
他让郑芝豹率领五千人、一百条船在澎湖列岛留守。
自己则亲率三百条大小战船浩浩荡荡地杀向了奥伦治城，荷兰守军在目睹这一鼎盛容后，慌忙将粮食等补给都归入热兰遮堡垒。同时普特斯曼还要求城内的华人不准出门，并拘禁了一些地位比较重要的华人代表。随后又下令没收所有华人小船，不给内部渗透者以任何通敌机会。做完这一切，普特斯曼稍微松了口气。
奥伦治城是典型的欧式近代化要塞，除主体结构的棱堡与半月堡外，还有矗立在外围沙丘上的乌得勒支堡能提供额外火力。奥伦治城分为上、下两城，上城又有上下两层，上层最中间是一座四方形的三层建筑，其高度达到了三丈左右。
城墙的四周各有一座棱堡，每座棱堡有十二门加农炮。在山脚下层又建造了四座半圆堡和两座棱堡，每座半圆堡有三门加农炮，两座棱堡各配置四门加农炮。此外，在城南南方制高点上还有一个碉堡炮台，配置了十二座加农炮。并且在最外围又布置了一层木栅栏，挖掘了壕沟。
这座不大的城里，有八十门最先进的加农炮！这也是普特斯曼的信心来源。
郑芝龙的船队一靠近，便受到了来自城内和战舰上的炮火攻击。再加上这片水域地形复杂，导致第一次进攻连对方的城墙都没摸着，被击沉了十几艘船后惨败而归。
这些普特斯曼彻底放了心，奥伦治城地理位置优越，易守难攻。我就不出门，耗
…。。