3是要保证工人组织的纯洁性，拒绝地方黑恶势力对各码头工人的压迫和控制。准予工会建立工人纠察队，以作为保卫工会的武力。
另外，关于工会组织的管理和渗透，可在社会调查所下新增加一个部门。这样，社会调查所升级为社会调查局，下面各科室升级为处。工会管理处不仅仅要管理运河码头工人，也要管理煤炭业、冶铁业及京城各工坊的工人。
我不要求你们能够完全控制这些工人的行动，但是最起码要让我知道，这些工人们的生活状况和思想状况，还有他们的主要需求是什么。没有我的命令，工会管理处安插在工会的成员，不得干涉工会组织的工人运动。他们的主要任务就是搜集工会情报，和监控工人的思想言论…”
吕琦听完之后，颇为不解的问道：“这个工会为何还要反对官府？陛下当初建立工会的目的，不就是为了让工人能够更好的服从于朝廷的管理吗？”
朱由检不以为意的回道：“一个事事都站在官府立场的工会，你觉得会得到那些码头工人的真心支持吗？没有工人支持的工会，又有什么存在的价值？
听从地方官员的指令，未必就是维护了朝廷的利益。迫使这些地方官员向朝廷求助，让他们意识到自己的权力有赖于朝廷的支持，而不是当地士绅豪商的支持，这同样也是维护了朝廷的权威。
那些商人们天天抱怨朝廷收取的商税过高，究其根本，还是朝廷给予这些商人的方便太多，让他们以为他们现在享受的一切都是理所当然的。我们要让他们明白，没有了朝廷的帮助，就算是平日地位低下的码头工人，他们也一样摆不平…”