朕看可以把太湖号及三艘明级军舰编入东协舰队，太湖号的试航，不如就从护送本年度前往欧洲的商船船队开始。不经历远洋航行的风浪，总是不能称之为海军的…”
朱由检还在同许心素谈论组建东协舰队的事宜时，返回到武英殿总参谋部的孙承宗已经开始了紧张的布置。一份份命令在他的口述下，经由总参谋部的参谋们发往了前线各部队和京畿地区的后勤仓库。围绕着辽东的大明各军事单位，第一次完整的通过总参谋部的指令联系在了一起，成为了一部运动起来的庞大机器。
由于大明和后金之间在商业上的紧密联系，锦衣卫情报系统的革新，密码及鸽信的运用，后金军队的大部调动状况，基本上已经为总参谋部所掌握。
比如黄台吉在领兵前往朝鲜后，留下了卫齐、济尔哈朗守卫沈阳，阿济格、阿巴泰守卫辽河一线，岳托、德格类守卫义州和北镇。
岳托、德格类率镶红旗、正蓝旗一万五千人马，加上这一地区放牧的蒙古诸部能够拼凑出的八千-一万人马，总计兵力在二万五千上下。
而守备辽河的阿济格、阿巴泰手下又大约有万余人马，因此明军想要进攻义州，首先就要面临后金约三万五千人马的围剿。
孙传庭在抵达辽西之后，就一直在调查检阅各部明军的真实战斗力，以确保自己制定的作战计划能够顺利完成。
十月一日，总参谋部的命令终于传达到了孙传庭的手中，已经抵达的锦州的孙传庭，立刻下令召集锦州文武官员，传达总参谋部的命令，组建前敌指挥部。