虑了数分钟向明军派出了使者，请求明军保护城内军民的财产和安全，他们愿意投降。
梅之焕带兵进入托克逊城内时，阿布都拉哈汗已经带着3万5千人马走过了博湖，距离托克逊城大约还有200里路程。
而也在这个时候，返回部族的固始汗终于和巴图尔珲台吉达成了妥协，决定带着2万人马从乌鲁木齐南下进攻吐鲁番。不过当他们走到海西的时候，收到了梅之焕发出的请求，要求他们南下托克逊和明军汇合。
托克逊已经靠近吐鲁番盆地西缘，这里也是吐鲁番盆地的风库，一年有将近一半时间刮大风。而从天山山脉流下的河流，又在这里冲蚀出了条条河沟，在数千年来风和水的共同作用下，这里的地形变得极为复杂，能够供人行走的道路只有少数几条宽阔的河沟。
一直以来，控制着阿拉沟和甘沟古道的托克逊城，都是控扼天山南北通道的要地。明军夺取了这里，实际已经将阿布都拉哈汗的援军堵在了西南山沟之。
但是梅之焕显然并不满意明军止步于吐鲁番盆地为止，退回去的阿布都拉哈汗依然拥有库车、和田到库尔勒之间的广大地方，一旦对方选择同叶尔羌汗握手言和，从吐鲁番到喀什噶尔的商道等于依然是被其控制着。
所以梅之焕决心借助托克逊城的有利位置，和阿布都拉哈汗打一场守城战，等到双方僵持不下时，由卫拉特部给予阿布都拉哈汗侧面狠狠一击，一次性击溃阿布都拉哈汗的主力，将托克逊到阿克苏之间的地方全部纳入到大明的控制之下。
为了达到这个目的，梅之焕令吐鲁番自卫军将城内的居民全都迁移到了别处，并将12门火炮运到了托克逊，在城内修筑了居高临下的炮垒。
10月15日，梅之焕刚刚将托克逊城改造完成，阿布都拉哈汗的弟弟伊斯玛依勒王子带着3000前锋抵达了托克逊西面的甘沟。在一队性急的叶尔羌哨探冲到城下被明军消灭之后，伊斯玛依勒王子才发现托克逊城居然已经被明军占据了。
托克逊城在沟顶，而他们则在沟底，虽然甘沟底部极为宽敞，足以让数千叶尔羌的军队排出进攻阵型，但是将近6、7百米的缓坡，让进攻的军队完全暴露在了明军的火器射击之下，因此伊斯玛依勒王子只是试探着进攻了两次，便在沟底扎营不再让部下去送死了。
阿布都拉哈汗收到了弟弟的消息后并没有下令退兵，而是命令后军加快了步伐前进。阿布都拉哈汗抵达了托克逊城外，下令部下发动了几次攻击后，便胸有成竹的对着弟
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