后，他火线截肢、消毒、包扎，以独臂继续坚持在海上控制马六甲海峡。
科恩见无力翻盘，只得带着舰队向西逃窜，再向南到苏门答腊和爪哇岛的据点。
惊魂稍定以后，科恩一面派人赶紧联系尼德兰本土，一面赶紧派人探查巴达维亚是否安全。
明军这边没有追击。
一来是损耗很大，葡萄牙人残存的20几艘战舰几乎都报废了，明军的战舰也损坏很大，需要半年以上的时间修理。
二来是有更重要的任务，那就是彻底控制马来半岛。
战舰损坏严重不能追击尼德兰战舰，蔡复一决定按照王宏宇的说法：「人不犯我，我不犯人；人若犯我，我必犯人」的原则行事。
此事王宏宇事先早有预见，在东南亚大明要树立威望。
既然柔佛动用举国之力侵犯我新加坡、马六甲，那就让他付出代价，一不做二不休，干脆把柔佛灭了，把马来半岛全部收为己有，接着继续攻打柔佛王国。
柔佛的国王被侯采击毙了，败军零散逃回去了，明军当时急着救援马六甲要塞，兵力有限，没有继续追赶。
柔佛王族和其他贵族本来就反对国王自不量力，不顾大家的反对悍然侵犯大明，既然国王战死了，以国王的儿子尚小为由拥立国王的堂弟为王。
新国王和贵族们知道柔佛远不是大明的对手，原先依赖尼德兰海军还可以勉强一战，现在尼德兰人被大明打跑了，倭寇也逃亡了，只能派使臣求和。
【鉴于大环境如此，
但是柔佛把入侵大明的新加坡定义为收服失去100之久的国土，始终不承认是入侵大明；大明则拿出从葡萄牙接收星城的契约，说明此事与第三者柔佛无关。
双方一开始就在原则问题上谈到了僵局。
哪一方都不肯放弃原则问题，谈判无法继续进行下去了。柔佛不承认入侵新加坡，他们提出的其他条件就被蔡复一一口拒绝了。
蔡复一并且勒令柔佛国投降，当一个大明的附属国家，否则大明大军一动，柔佛王国便会玉石俱焚，柔佛王国就不存在了。
柔佛新国王刚上台就投降大明，他怕王族人不干，只好召集王族、大臣讨论。
王族首先不答应，大臣均是贵族的代理人，甚至还有尼德兰的傀儡。
他们站在贵族、尼德兰的立场上坚决反对投降，几乎百分之百都是主战派。
他们认为大明现在可战之兵只有一万，并且是疲敝
…。。