马监一切顺利，但是城西的京营就遭到了意外。
朱由检指使工部文官引爆了王恭厂：
100万斤以上火药的巨大爆炸，巨大声响传播百里、天色昏黑如夜、屋宇动荡、灵芝状烟云等疑似有强烈地震、龙卷风。
平叛的忠诚京营兵马，直接死伤惨重。
袁崇焕等人乘机造谣：说这是由强烈地震、龙卷风、陨石甚至超自然力量才有可能产生的离奇现象，单由火药库爆炸是不足以造成的。
再加上事件发生后，爆炸范围附近的伤者和尸首皆发生衣服被卷去而致全身赤裸、***的怪况。更给此灾变蒙上了一层神秘色彩。
其实这是大爆炸把周围的空气挤压到了周围，爆炸范围内形成了真空，人和动物因为缺氧窒息而死。爆炸后空气回流形成了龙泉风，龙卷风自然能把衣服剥离卷走。
他们说这是天启皇帝倒行逆施激怒了老天，这是上天降下的灾难惩罚天启皇帝的，无辜百姓受到了天启的牵连，强烈呼吁天启皇帝退位。
高起潜率领一批南海子净军从京城西南入城。
袁崇焕、叶向高、朱纯臣也率领蓟镇一些兵马谋反，他们早已去了蓟镇做好了叛乱准备。
趁着御马监和锦衣卫主力不在，
太监曹化淳带着一批游侠，在收买的太监接应下，直接杀进宫中，放火点燃了三大殿。
又直接朝着乾清宫杀去。