直接对内阁负责，所以权限相当大，不仅可以在平日行动的时候抽调公安力量，还可以在特殊时刻直接指挥自卫队令其协助，其他部门无权干涉不说，还要在他们需要的时候尽可能的配合。
妥妥的一个神盾局的岛国版本。
下属一司三科两室。
其分别是阴阳司——原阴阳寮部门，主要负责岛道境内宗教人士交流和犯罪的处理工作。
内部多为传承人员，所以虽然人数不多，但综合实力很强，是超自然灾害对策局的托底部门，因此人员有些超然物外，一般情况下是不会被派出执行外勤任务，所以非常少见。
跟着则是特情科——说白了就是情报部门，监管全国范围内的灵异情况和地脉灵动。
当然，也不排除对外国势力的探测就是了。
然后是特侦科——也就是伊万里胡桃所在的科室，负责境内超常犯罪的侦破工作。
再然后才是超自然事物处置科——也就是秦和清曾在祭典上碰到那群官方人员出身的科室。
主要由普通人和有特殊才能的底层人士组成，是整个超自然灾害对策局的基础所在，负责巡查全国，镇压、处理各地区出现的通常灵异事件。
而后才是两室——超自然灾害对策室与装备研究及开发室。