朱慈烺继续布置瘟疫防控，同时等候吴三桂这个大功臣进京参拜。
朱慈烺又召唤礼部尚书倪元璐出列，叮嘱道：“根据侯阁老所言，瘟疫已经在闯军中发作，京城只怕也难以避免，你们礼部立即组织太医院的人准备大量药材，再从民间招募大量的医匠，力争做到有备无患。”
倪元璐抱着笏板领命：“老臣遵旨！”
朱慈烺又召唤工部尚书范景文出列：“你们工部立刻组织工匠在天坛东边的空地上修建方舱医院……”
“方舱医院？”
范景文一脸懵逼，这是个神马东东？
朱慈烺解释道：“方舱者形似船舱，密切封闭，只留少许门出入。医院者，医治病患的院子，此谓之医院。
通俗点说，就是用来隔离瘟疫患者的院子，只要查到有人患上了瘟疫，就立刻送到方舱医院里面来隔离治疗，绝不能让他继续留在民间传染病毒。”
范景文这才恍然顿悟，连连称赞：“妙啊，太妙了，太子爷这个方法妙，把染了瘟疫的人全部关到一起，就避免让他们继续传染了。”
经过一场谋划，近万名俘虏总算逃过一死，但朱慈烺知道疫情才刚刚开始，在未来很长的一段时间内，控制瘟疫的重要性不在剿灭李自成之下。
“明日各部依照本宫的部署行事，侯恂负责总督防疫，不得有误。今夜除了诸葛良负责掩埋尸体之外，其他文武官员全部跟随本宫前往文华殿赴筵，为平西伯和戚志光以及所有的将士庆功。”
朱慈烺拍了拍诸葛亮的肩膀，表示慰问，“诸葛爱卿啊，今夜你就多操劳了！”
你小子才二十六七岁，短短几天的时间就爬到了兵部侍郎的高位，能者多劳，别人喝酒你干活，也让其他大佬们心理平衡一点。
诸葛亮又如何不懂朱慈烺的意思，作揖告辞：“臣这就去调度兵力，随我出城焚烧掩埋尸体。”
朱慈烺又命徐来福即刻回紫禁城给诸葛亮取一把尚方宝剑过来，命他今夜全权调度诸军，谁敢不从，先斩后奏。
又吩咐锦衣卫指挥佥事展昭：“诸葛侍郎初到军中，唯恐有人不服，你今夜携带五百锦衣卫护卫诸葛侍郎，胆敢不从调遣者，斩无赦！”
“谨遵太子殿下口谕！”
展昭领命后向诸葛亮抱拳寒暄：“诸葛侍郎放心，有我们锦衣卫护着你，保证谁也不敢造肆。”
“哈哈……那就有劳展佥事了。”
诸葛亮作揖还礼，和展
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