止了进一步扩大战果的进攻命令，而是命令在现占据的领地上立即结寨自保，在防备建奴的同时，立即丈量牧地，划分行政区域，同王在晋以及毛文龙一起决定将部分辽东军和东江兵派驻这些行政区域实行临时军管，并等待朝廷吏部选派流官来治理。
朱由校的授意就是在今后的对外战争中，一旦收复和占领领土，就不必打了就回，或者最多扶持依附大明的土著来做羁縻官，如今的策略是直接实行改土归流，将这些关外土地直接承包给底层民众，并由大明朝廷直接管理行政与军事。
对于什么蒙古王公，什么孛儿只斤的后代，什么黄金家族以及辽地的军事地主们，一律铲除，并鼓励底层的民众对其进行反抗，当然现在喀尔喀部、科尔沁部以及吴氏关宁军已经被禁卫军歼灭，所以也没什么对朱由校改土归流进行反动的势力。
底层的蒙古鞑子们倒也没想到大明在占领他们的家园后，会将原本属于部落首领的领地直接分给他们，一时间倒也是积极性颇高，面对一张写明了数十亩分布在各地的机动草原（考虑牧民畜牧因水草季节性更迭而这样设置）领地文书，很难有底层蒙古牧民反对大明的统治。
甚至，在刻意的蒙古歌曲宣传下，再加上之前的飞天营和各类被称为妖风的化学武器使用后所带来的神秘感，让这些底层蒙古牧民不得不相信大明皇帝陛下朱由校才代表着长生天，而朱由校的影响力也因此由局限于关内而延伸到了关外。
意图卷土重来的喀尔喀部和科尔沁部的王公们会发现，如今的漠南蒙古再也不是以前的漠南蒙古，在这里他们不但再找不到一个支持者，反而当他们派游骑以联络旧族出现后，蒙古底层牧民反而将他们绑到衙门去。