和生产方式改变导致经济的越来越繁荣和各种新兴行业和新的投资方式的不断涌现后，大明朝廷的行政体系也开始出现无法支应的现象。
以前的大明朝廷只是一个由朱元璋建立然后充当一个维持小农经济稳定的中央集权政体，他更多的功能是在对小农经济的条件和支持还有为朱氏家族乃至于其他统治者占据更多生产资料，其服务性是相对较少的，但现在需要朝廷提供社会公共服务与宏观调控的地方越来越多，也就使得大明现在的行政体系已经开始渐渐的无法支持整个大明的发展。
朱由校也在想是不是要改革一下行政体系，特别是六部是不是要进一步扩充，比如现在的户部是不是要直接分成财政、民政、商务、审计、国土资源等部，因为现在户部实在涵盖的功能实在是太多了，朱由校任命的户部侍郎已经不下六位，官职重叠性太高，而一个户部尚书权力已然太大，因为他几乎就控制了大明所有的经济脉门，搁在现代就相当于于一个副总0理了。
不仅仅是户部，即便是礼部现在也是后世教育、外交、文化等后世好几个大部门的杂糅。
如实搁在以前小农经济为主体时代，由于社会主要生产方式就只有农业，其他行业并不很发达，整个国家的行政体系倒能运转。
但现在，光是在教育方面，因为朱由校要求在未来五年普及到每一个大明孩童都能上学五年的旨意都能让礼部无法完成，因为一个礼部还得忙着科举与各种新兴报刊的审核等事务。