事件后，受到牵连，被调往了第二师团任师团长，且第二师团还是独立混成旅团，都无法排进关东军甲乙丙丁四级师团之内，属于战斗力相对薄弱的师团。
换言之，等于是剥夺了石原健次的权力。
石原健次被调职之后，写了一份报告，认为三宅恭次建立的秘搜课起不到任何作用，与其这样做，不如将大部分精力用在如何稳固满洲人民的精神世界之上。
久保天道说：“将军，我不大理解石原将军所说的稳固精神世界，是什么意思？”
三宅恭次转身看着两人：“石原健次是伊藤博文的崇拜者，他并不推崇武力取胜，而是希望通过精神层面的控制，来达到帝国的最终目的，也就是建立大东亚共荣圈。这与军部的想法完全背道而驰，实际上，将他调离司令部并不是因为本庄信义事件，而是因为他那可怕的想法，不过石原家族在本土有着稳固的势力，就我得知的消息，军部上层考虑过了他的想法，但因为资金有限的关系，到底是支持我，还是支持他，军部还拿捏不定。”
前田政次道：“将军，我还是不明白精神层面的控制到底是什么？”
三宅恭次道：“他的意思首先是整顿军纪，不允许在占领区扰民，要与占领区的百姓公平交易，对待他们要像对待我们日本国民一样，这样下去，假以时日，占领区百姓的心就会完全倾向于我们大日本帝国。”
前田政次和久保天道对视一眼。
“我知道你们在想什么，你们也觉得这套方法完全可行。石原健次也曾经拿满清举例，他说，满清入主中原之后，也是用的武力征服，但当武力征服达到了一定的阶段，就改为了精神层面的控制。”三宅恭次冷冷道，“满清占了中原之后，要求人民留辫子，大部分人抵死不从，但最终还是服从了，可几百年之后，中国人似乎忘记了曾经他们的反抗，在辛亥革命之后，新政|府要求人们剪掉辫子的时候，又有很多人抵死不从，石原说，这就是精神层面控制的结果。”