刘基这次回到上源城的北方大都督府，除了对破虏军的编制重新进行了制定之外，还对北方大都督府下辖各个州的行政区做了一番调整。
刘基把西域都护府的三十个州，划分为了十个道，每一道下设三个州，管理一道之官员为巡抚，刘基任命宋濂、高启、黄子澄、齐泰、杨士奇、杨溥、杨荣、解缙、孔融和陈琳这十名顶级文臣，为西域都护府十个道的巡抚。
刘基又把北庭都护府的二十四个州划分为了八个道，每一道依然下设三个州，任命晁错、霍光、主父偃、魏相、邴吉、姚崇、张说、张昭这八名顶级文臣，为北庭都护府八个道的巡抚。
刘基还把黔州、邳州和梅州划为了一个道，由伍子胥任巡抚之职，秦州、襄州和涪州划为了一个道，由蒋琬任巡抚之职，渝州与西南的桂州、横州划为了一个道，由范增任巡抚之职，西南的郁州、钦州和雷州划为了一个道，由黄霸任巡抚之职。
东南七州以及从鲁国手中夺取的潞州、绛州、汾州、泽州、宪州、代州、岚州和忻州，一共被划为了五个道，每一道同样下设三个州，刘基任命龚遂、顾雍、诸葛瑾、华歆、陈登五人为这五个道的巡抚。
东蛮都护府因为只有滑州和宪州，刘基并没有设置道一级的行政区，刘基让顶级文臣周昌洺和寇曦分别担任了滑州和宪州的州牧之职，他们两人都是刘基在现实世界里面招揽的顶级文臣。
刘基之所以要在州之上，设置道一级的行政区，完全是被逼的，如今破虏军的地盘越来越大，整个北方大都督府已经下设八十三个州，就算一个州派遣一名顶级文臣坐镇，刘基麾下的顶级文臣也不够分，于是刘基只好把三个州划为一个道，这样只需要一个道派遣一名顶级文臣去坐镇就可以了。
至于各州的州牧，刘基让各道的巡抚去任命，如果一名巡抚手底下没有合适担任州牧的人，那这名巡抚只好辛苦一下，在做巡抚的同时，还需要兼任三个州的州牧之位。
设置了道一级的行政区之后，刘基手中的顶级文臣顿时宽裕了许多，于是刘基在破虏军十大军团之中，设置了军师之职，地位仅在各军团统帅之下，十大军团的军师分别为房玄龄、李儒、陈宫、田丰、沮授、杜如晦、鲁肃、长孙无忌、荀彧和荀攸。
张良、郭嘉、王猛等十几名顶级文臣，则留在了北方大都督府各司其职。
刘基接到朝廷召他进京的旨意之后，并没有马上就带兵去苍龙城，此时鲁国按照与破虏军签订的停战协议，已经派人把鲁国靖
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