二次革命及讨袁。1913年二次革命时，陈其美被推举为上海讨袁总司令。1915年初，陈其美在上海和江浙一带，先后策划了一系列反袁军事行动。1916年5月18日，陈其美在上海日本友人山田纯三郎的寓所被袁世凯派的枪手所杀。1920年，在上海经营证券物品交易所，股东有委员长等南京政府人士，曾获利颇丰。所得利润部分用作支持南京政府革命。其弟陈立夫。
1924年，委员长主持黄埔军校筹建，陈果夫在上海代其处理军用品采购、人才招揽等工作。1926年陈到广州，当选为南京政府第二届中央监察委员，并任中央组织部代部长。1927年4月初，与南京政府内右派吴敬恒、张静江等提出弹劾红党案，为之后的清党准备。1928年，委员长复出，陈果夫任南京政府，政府委员，兼监察院副院长。实质负责南京政府内组织，整理党务及进行清党。除重新审查登记南京政府党员，并开始设立调查组织，即后来专门负责反制"中统"。1929年任中央执委，中央组织部副部长，成立南京政府中央政治学校。二陈掌管南京政府党务机构，至使当时有"蒋家天下陈家党"之称。1932年，陈果夫为"导淮委员会"副委员长;1933年，兼任江苏省政府省长，负责整治江苏及淮河水利。
这个时候的戴笠和王亚樵的关系还是相当好的，戴笠亲自过来说情，王亚樵说，雨农兄，不是兄弟不帮你，因为我们这里和你们哪里不同，我们这里最厉害的就是廉政公署，我们这里人的工资很高，就是不希望有贪污的出现，还有就是大烟在我们这里是绝对禁止的，没有枪毙已经算是法外开恩了，其他的就不要在想了，你我之间是兄弟，你也是搞情报工作，我也是搞情报工作的，大家之间都可以理解，还有就是叫委员长放心，我们这里会增加五千万美金的税款来帮助你们南京政府的，不要老是想那些歪门邪道来赚钱，你也知道我们就是一个虹口区和宝山县一年都可以赚近五百亿美金，现在我们的收入基本上和美国一样，我们帮你们搞了个大型的钢铁厂，你们就可以高一些另外加工的工厂，这样也可以赚钱。
一个钢铁厂的下游产品就可以让你们南京政府的财政收入带来几个亿，但是就是你们的人想不到，你看看我们这里的宝山钢铁厂，就一个宝山钢铁厂的下游产品一年就近100亿美金的收入，不要说那时想着造枪造炮的。也可以发展一下下游的产品，你看看我们的卡车，吉普车，都是所有下游的产品。雨农兄，其实我们这里的人就是不喜欢中统的那帮人，你就不要为
…。。