锦衣卫已成为一个有别于其他禁卫军的建制。
“掌直驾侍卫、巡查缉捕”，这一句话就包括了锦衣卫的两大执行机构与职权，锦衣卫保留了大汉将军一职，主管皇帝侍卫、展列仪仗、传递皇帝命令以及职掌廷杖等事项。
另外锦衣卫下设置了经历司和南、北镇抚司。
经历司主管锦衣卫公务文书的出入、誊写及档案封存等事项。
南镇抚司主管一般卫、所部队人员之犯罪侦查、审讯、判决、情报以及军事武器之研发事项。
北镇抚司主管各地藩王及官员秘密监视、肃反肃贪，独立侦讯、逮捕、判决、关押权力（诏狱）以及反间谍事项。
段飞听了古腾的详细介绍才知道锦衣卫竟然拥有如此多的职能，锦衣卫是当初太祖朱元璋为了全面控制整个国家而设置的单位，后来又经过朱棣的增强，一个锦衣卫已经相当于后世国家安全局、联邦调查局、中央情报局、廉政公署、宪兵队、军事法院、军事检察署、以及军备局等等机构的集合体……