玄机门在三十年前曾是天下第一名门，这个天下当然也包括朝堂和江湖。而如今天朝立国不足百年，异姓王出身的天家能在前朝末期群雄并起下脱颖而出，进而掌控天下，仅靠一族之力当然不行，这其中自然离不开玄机门的鼎力辅助。玄机门门主玄机子出身鬼谷一派，是当时公认的天下第一高手。玄机门下设三个组织，天字组、地字组、人字组。三个组织各司其职，天字组精研天文星象、机关阵法、火药器械；地字组拥有最强大的兵法战术和数万精锐徒众；人字组负责财物情报，拥有遍布天下的商铺和密探。如果单论当时的实力而言，玄机门确实有能力颠覆立国之初尚未站稳脚跟的天朝的。这当然不是当权者想要看到的，但玄机门实力强大，又坐拥开国之功，更有名闻天下的一代宗师玄机子坐镇，当权者天家最初自然也无可奈何。
事情的转机出现在第二代，继任太宗皇帝天世林在开国征战之时便屡战屡胜，战功标榜，手下能人异士无数，是个雄才大略之辈。而恰恰在这个时候一代宗师玄机子离开玄机门游历江湖，近十年不知所踪。
在这多方因素主导下，“兔死狗烹，鸟尽弓藏”的一幕在上代皇帝天世林的精心密谋下产生了。
天世林虽然有心要把玄机门连根拔起，但当时的玄机门实力超群，能人辈出，又据守君山天险，在山门之下一场大战后双方斗的两败俱伤。
初战过后，趁天朝调兵遣将之际，当时的玄机门掌令使雪千寻只身独闯皇宫大内连毙当时的皇宫三大高手，吓得天世林躲到龙椅之下。值此千钧一发之时，玄机子的老友，龙泉禅寺的大悲和尚忽然现身皇宫太极殿，拿出玄机子的手书为天世林说情，雪千寻这才罢休。
在大悲和尚的调解下，天世林收回铲除玄机门的成命，当着文武百官下诏向玄机门致歉；而以雪千寻为首的玄机门则交出天字组，解散地字组，仅保留人字组归隐君山玄机山庄不问朝堂江湖之事。
江湖人大都不解，雪千寻明明占了上风，结局为何还是皇家得利，难道仅仅是因为当今天子的一纸致歉文书吗？
其实局外人又人哪里知道，玄机门掌门玄机子出自鬼谷一派，而鬼谷派的宗旨正是：逢乱世而出，辅助明主平天下而福百姓；天下之道，以人为本，以百姓安居乐业为己任。
玄机子当初隐退山林之际，曾留下手书两封，一封留给当时的玄机门长老会，一封交给老友大悲和尚。手谕内容便是：“天字组交付当朝，福祉与民；解散地字组，或归于江湖；留人字组一脉香
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