一只手握着自己的命，你们之中有一个会死，但选择权，在你的手里！”
先知不愧是先知，说的话莫名其妙，至少，很多观众都感觉有点似是而非。
之后，众人准备离开矩阵时，因为塞弗的背叛，众人遭到了追杀。原本设定好链接现实的电话线都被剪断。
这些电话线，是他们和现实之间的出入证。一开始安妮在电话亭里消失，就是这个原因。
最后，大战爆发。虽然战斗很炫酷，枪火交战很刺激，但结果却是悲剧的。
墨菲斯被雨果抓走，塞弗利用自己和特工是友军的身份，在没进入矩阵的接线员不知道他已经背叛的情况下，他成功利用接线员的信任，先一步回到了现实世界中。
然后又用武器偷袭接线员，并在之后一一拔掉进入矩阵的船员脑后的插头，让他们直接当场死亡！
这就是可悲之处，没死在杀毒软件手里，死在了自己人的手上。
就在塞弗要把拔掉尼奥的插头时，之前他本以为已经死去的接线员却大难不死，幸存了下来，并且成功将他反杀！
但即便这样，船员们除了墨菲斯和男女主角外，其他进入矩阵的人，通通都死完了。
而且，这不是最主要的。仅存的几个人面临着一个更大的难题。
那就是墨菲斯被抓走了，一旦雨果从他的口中套出锡安主机的接入口令，那么，人类最后的聚集地，将会毁于一旦。
所以，他们别无选择，只能拔掉墨菲斯的插头，让他死掉。死人，总是保守秘密的最佳人选。
就在这时，尼奥突然想起了先知对他说过的话。他要做出选择，在他自己和墨菲斯的性命之间。
现在，就是做出选择的时刻了！
黑客帝国作为商业电影，肯定有商业电影的风格，作为救世主的主角肯定要甩一甩王霸之气啊。
所以，他选择再次进入矩阵，以身犯险！
无论是为了墨菲斯这个兄弟，还是为了全人类！
........
看到这里，很多观众也是感慨不已。尼奥要去救墨菲斯，谈何容易？
关押墨菲斯的地方，三个特工都在，还有数不清的警察严阵以待，想要突破重围，并在雨果这几个杀毒软件手下救人，无疑是异想天开。
没看到众人之前见到雨果几人就跑吗？
无他，因为这几个怪咖，打又打不过，杀又杀不死，杀死了还能复活。这种逆天的存在
…。。