其改名为“青云圃”隐居，躬耕悟道，创作书画，六十二岁时把道院交给徒弟主持，只身离开青云谱，在南昌抚河桥附近修筑“寝歌草堂”，进行挽起医术创作，度过了八十岁，康熙四十四年初冬，病逝于“寝歌草堂”。”
“一生对明忠心耿耿，以明朝遗民自居，不肯与清合作，作品以象征手法书写心意，如画鱼、鸭、鸟等，皆以白眼向天，充满倔强之气，这也是朱耷心中写照。画山水则夺去荒寒萧疏之景，剩山残水，仰塞之情溢于纸素，“墨点无多泪点多，山河仍为旧山河”，“想见时人解图画，一峰还些宋山河”。朱耷寄情于画，以书画表达对旧王朝的眷恋。”
“也正是因为如此，才会被清廷说成是企图披上袈裟以掩护抗清运动，朱耷画一只单腿着地、耸背曲颈的鸟，会被看做与清廷势不两立；画一只孔雀，会被引申成讽刺带着顶戴花翎的清朝大官；画一只向上的白眼，会被解释为怒视满清朝廷；他的许多落款和画押，都会被不断揣摩和联想，是否像是“思君”二字，甚至是画押的形态仿佛是“三月十九日”，这个崇祯皇帝上吊自尽的日子。”
“六十岁开始，朱耷开始用“八大山人”这个名号，按照后世史学家的解读，“朱耷”已经，去掉牛、耳便是八、大。而牛耳又可指代政权，所以明朝被满清灭国之后的皇室宗亲就只剩下了“八大”。用朱耷自己的话‘四方四隅，皆我为大，而无大于我也’。”
“八大山人的落款很多，最被人津津乐道的当属‘哭之’和‘笑之’。”