驾崩，遗诏所有诸位不得进京吊丧。孙子朱允炆即位，是为明惠帝，他感觉叔叔们手握重兵，权力过大，严重威胁着中央政权。于是朱允炆和顾命大臣齐泰、黄子澄等密议削藩。
朱允炆自知燕王朱棣势大难图，就从朱棣的同母弟周王动手。周、代、岷、湘、齐诸王先后削夺，湘王**，其余人都被废为普通人，逼得坐镇北平的燕王朱棣实在坐不住了。
建文元年(1399)六月起兵前夕，朱棣设计擒获朱允炆在北平安插的眼线布政使张昺、都指挥使谢贵。清除了潜在的危险以后，经过精心准备近20年的朱棣要动手了。
朱棣打出了“清君侧，靖国难”的旗号，向朱允炆发难，他要从侄儿手中夺回原本是属于他的皇帝宝座，朱棣在大哥死后一直就是这么认为的。于是，一场争夺皇位的内战——靖难之役于七月爆发，杨璟从瀛西返回北平，随为了迷惑朱允炆，朱棣给杨璟封了个百户候（北军百户令），其时确实先锋总指挥。
燕王起兵不久就攻取了北平以北的居庸关、怀来、密云和以东的蓟州、遵化、永平（今河北卢龙）等州县，扫平了北平的外围，排除了后顾之忧，便于从容对付朝廷的问罪之师。
朝廷军50万浩浩荡荡杀来（后期60万），燕王胆子可真够大的，以12万精兵对抗。燕王善用计谋，又有杨璟统率的杨家将将士打头阵，燕军奋不顾身，不惧生死，打得朝廷军节节败退，李景隆一路逃跑。
气得朱允炆撤了李景隆的统帅职位，换上盛庸担任大将军，东昌一战，包围了朱棣的前锋部队，杨璟、杨洪父子死战，杀退了一波又一波拼死向前的朝廷军，直至朱能的援军到来才得以突围。郑和（三宝太监）派人给燕王送来密信，说京城空虚，尽快率兵南下。
战争进行到第四个年头（1402）四月，燕军进抵宿州，与跟踪袭击的南军大战于齐眉山（今安徽灵璧县境），史称灵璧之战，几经交战，双方互有胜负。考虑到在河边不易防守，朝廷军何福移营，与平安在灵壁(一作灵璧)深沟高垒布防，采用阻击战，准备拖垮靖难军。
忽然斥候回报：“南军平安亲自率兵六万护卫粮草。”
“善。”朱棣闻之狂喜，采取出其不意的战术，打一场偷袭战，他要生擒这个让他吃了不少苦头的大明武士。
四月廿七，朱棣率精锐一万人突然袭击朝廷军的送粮队伍，将朝廷军拦腰折断。朱棣和杨璟等突入敌阵，大呼奋击，两阵矢交如雨。
朝廷军不停地冲着朱棣
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