行军途中，拖雷竟然莫名其妙的离世了，窝阔台乘机将拖雷的军队收归自己手中，剪除托雷家族的威胁。
1233年六月，金哀宗从归德逃奔蔡州，蒙古将领塔察儿率部围攻，因军中缺粮，将士困惫，蒙古要求南宋联合攻打。南宋朝廷皇帝认为向金复仇的机会来了，于是派出2万军队，送粮30万石，帮助蒙古攻蔡州。在宋蒙军队的南北夹攻下，金国腹背受敌。
1234年春，宋军攻破南城，蒙古军攻破西城，金哀宗在幽兰轩自缢而死，金国灭亡，一直憋屈的南宋总算出了一口恶气，可蒙宋两国的“友好”关系并没有维持多长时间。
1239年，拔都率领的“长子西征”大军灭十余万灭掉了钦察、不里阿耳等国，窝阔台命贵由、蒙哥返回蒙古本土。
拔都部也回驻也的里河下游，在那里张幕庆功。席间，拔都自恃年长，开宴时先饮一二盏酒。贵由、不里两个不服气，起而骂座，言辞极为恶毒。
拔都闻言，非常生气，他写了一封奏章，上报窝阔台大汗。窝阔台闻奏震怒，传旨说，今后不许贵由觐谒。
在场的蒙哥和阿勒赤歹（成吉思汗弟合赤温之长子）等人对窝阔台说：“成吉思汗在日曾有言‘军旅之事断于外，家中之事断于中’。贵由等人的事情属于军旅，应由拔都判决为宜。”
这几句话说得很得体，一来不致使窝阔台为处分贵由为难，二来也给足了拔都面子。窝阔台采纳了蒙哥二人的意见，把贵由交给拔都处理。
作为西征统帅的拔都心想：我总不能为此口舌之争而重罚皇太子贵由吧？既然大汗给了我一个台阶下，不如见好就收。因而拔都只是让贵由当着叔叔们和诸兄弟的面，赔礼道歉完事。但由此开始，贵由和拔都结下了深仇。
1241年11月窝阔台病死后，他的皇后乃马真氏临朝称制四年，两度发兵攻打南宋。1246年，乃马真氏还政于儿子贵由，是为大蒙古帝国第三代大汗。
贵由上台后，插手察合台家族的内政，迫使迫使察合台长孙哈剌旭烈让位于也速蒙哥，引起了哈剌旭烈的不满。在西征中与贵由不和的钦察汗拔都反对贵由继承大汗位置，两人结下冤仇。
1248年3月，贵由亲率大军准备攻打拔都，在离开和林西进叶密力的途中，突然病死，从而避免了一场皇室内部自相残杀的争战。
按照惯例，新汗未被推举出来之前，蒙古汗国的事务由皇后掌管。于是贵由汗的长妻斡兀立海迷失皇后抱着幼小的失烈门临
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