中了阿兰戈父子，以他们为首组成了“巴拿马爱国者小组”。
5月，曾任科隆高官，并长期在美国巴拿马铁路公司任职的曼纽埃尔·阿马多·格雷罗加入了“爱国者小组”，成为其首领。
6月14日，美国《纽约世界报》发表文章，鼓吹如果哥伦比亚政府一意孤行，仍然为美国收购法国运河公司的租让权设障，则巴拿马人民为捍卫自身利益，应该脱离哥伦比亚而独立。
7月，“爱国者小组”开始讨论独立起义的具体计划，并积极沟通美国，寻求帮助。
8月，阿马多到纽约会见了克伦威尔和瓦里亚，得到了美国政府将会支持独立起义的消息，瓦里亚表示，他已得到西奥多·罗斯总统和米尔顿·海约翰国务卿的明确承诺，美国政府将承认巴拿马独立并保护革命者。
1903年9月1日，美国国务院将起义需要的文件等物品交给了瓦里亚，包括军事计划、密电码、独立宣言文稿、巴拿马宪法、国旗等等，瓦里亚自己预支了50万法郎给阿马多，作为起义经费。
1903年10月20日，阿马多返回科隆，他虽对此行的成果感到欣慰，但又觉得光凭一个法国人的承诺，就拿自己的命运、事业甚至生命去冒险有些不妥，关键时刻，阿马多的妻子多尼亚·玛丽亚给了他巨大的精神支持。
这时，经过革命者的游说再加上5万美元的赠款，哥伦比亚驻军司令埃斯特万·乌埃尔塔斯决定加入“爱国者小组”，这对起义来说无疑是雪中送炭。
很快，阿马多又用3.5万美元收买了一位哥伦比亚炮艇艇长，事情发展到这一步，哥伦比亚政府终于察觉了巴拿马政局的异常动向，立即派2名将军率领40名士兵乘一艘炮艇前往科隆，以防非常事变，但此时美国巡洋舰“纳什维尔”号突然开进科隆港，公开阻止哥伦比亚军队进入巴拿马城。
1903年11月3日，两位将军刚到巴拿马城，下午17时就被已经叛变的乌埃尔塔斯逮捕了，阿马多通知美国领事馆，巴拿马已经与哥伦比亚正式脱离关系，阿兰戈父子在巴拿马城的大教堂广场，当众宣布成立巴拿马临时执政委员会，委员会的成员包括巴拿马上流分子和美国铁路公司的高级职员。当晚，巴拿马市议会举行特别会议，承认了这个新政权，
1903年11月4日，巴拿马举行群众，宣布独立，推选阿马多为共和国首任总统，阿马多在会上致辞时高呼：“巴拿马共和国万岁！罗斯福万岁！美国万岁！”的口号，成为世界外交史上的一
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