沈有容当然不甘心就这样让荷兰人逃走，悍然率船队追击荷兰人的舰队，双方在海上再次缠斗起来，此战一直从深夜打到天明，沈有容军烧毁海盗战船三十余艘，击沉海盗战船十余艘，烧毁荷兰战列舰两艘，击沉荷兰战列舰两艘，不过自己这方也伤亡惨重，带来的六十艘战船只剩下二十艘，士兵也只余二千多人。
这时盘踞在澎湖水寨的荷兰人又派了六艘战列舰赶来增援，沈有容不得不带着残部撤离战场。此战沈有容军虽然表现出了极高的作战水平，但也难以言胜，不过还是极大地打击了荷兰人的嚣张气焰，不敢再封锁漳州出海口了！
通过此战沈有容也意识到要想将荷兰人从澎湖列岛赶走，除了请郭致远出山别无他法，所以他亲赴东蕃，单膝跪在郭致远面前，悲声道：“请大人为福建百姓计，率军出战吧！……”
对沈有容，郭致远当然不能像对陈子贞那样搪塞了，连忙把他扶起来，叹了一口气道：“沈将军快快请起，非是郭某不愿出战，实在是名不正，言不顺啊！……”
沈有容并不知道郭致远有着更长远的布局，有些不理解地愤然道：“名分真的那么重要吗？沈某在大人麾下时，大人常说国家民族大义高于一切，此时却置国家民族大义于不顾，养寇自重，斤斤计较，不肯率军出战，莫非也是说一套，做一套，沈某真是看错你了！……”
郭致远也不恼怒，呵呵笑道：“沈将军你误会我了，我非是养寇自重，西洋人有句话说得好，上帝欲使之灭亡，必先使其之疯狂，我想要的不是一次战役的胜利，而是中国沿海数百年的太平！我要这个名分也不是为了我自己，而是为了中国沿海的长治久安，要想我中国沿海不被外敌侵略，就必须有一个秩序制定者，否则就算我这次将荷兰人打败赶走了，下次我离开了东蕃，荷兰人或者其他的西洋人又来侵犯又该如何是好呢？……”
沈有容有些似懂非懂地挠了挠头道：“大人，沈某是粗人，你就别绕来绕去的了，你就直说该如何做吧，只要你肯率军出战，便是要沈某赴汤蹈火，沈某也在所不辞！不过沈某位卑言轻，你若要沈某帮你向朝廷讨要名分，怕是很难办到……”
郭致远微微一笑道：“你办不到，自然有人办得到，这样吧，你去泉州找徐先生，他应该知道该找何人……”
沈有容只好去泉州找徐光启，徐光启如今已经升任泉州府知府，他对福建沿海如今被荷兰人肆虐的状况也很是着急，也不太明白为什么郭致远不肯出山率兵出战，听沈有容把郭致远的
…。。