阵法师在战斗中作用很大，是第三大分院。
医道院主修治疗各类伤病，救死扶伤，医师也很重要，是第四大分院。
符篆院主修各类符文、篆文的练制，辅助功能强大，是第五分院。
驯兽院主修各类妖兽的驯化，驯兽师实力强大，是第六大分院。
工器院主修各类机关兵器的铸造和设计，辅助作用强大，是第七大分院。
每个分院，又分为普通外门弟子、精英内门弟子、核心亲传弟子、圣子四大类。林枫现在的层次就是武道院的普通外门弟子，也是人数最多的弟子。
皇者学院地位最高的是院长，副院长有四人，副院长一般由各分院院长担任。这五人是皇者学院的核心领导机构，也是武力、功法、技能最高的存在，一般时间，人们都不见他们的身影。
各个分院也设有院长一人，副院长二人，这三人是分院的核心领导机构，院内考核、录用、奖惩等重要事情，都由他们决定。
各个分院都有若干导师，导师也可以从核心亲传弟子、圣子中考核选拔任用。
各个分院还有后勤、服务管理机构，设有外门管事、内门管事、学院管事三个类别。