以进出矩阵。
在这里，尼奥遇见了一对夫妻和他们的女儿。他们三个，都是程序。
而且，父亲十分爱自己的女儿。
听到一个程序说“爱”这个字，不仅是尼奥愣了片刻，连观众都是十分不解。
机器，也懂爱？
“这是人类的情感。”尼奥解释道。
“不，这只是一个词。”父亲摇摇头，“重要的是这个词所蕴含的联系。看得出来，你也爱着别人。能告诉我为了维持那种联系，你愿意付出什么吗？”
“一切！”尼奥毫不犹豫地回道。
“我也是。”父亲笑道。
这话一出，许多观众都是面色一滞。
一个程序，为了自己和女儿之间的爱，可以付出一切？
爱...爱.....一个程序也懂得爱了吗....
“爱不是情感，仅仅只是一个词？重要的是和爱人之间的联系？”
“这话从一个程序嘴里说出来，太难以置信了。”
“爱的确只是一个词而已，我们经常提及，但....也只是说说而已，做到....太难。不是每个人能为了爱而付出一切的。”
“话说，我竟然不如一个程序？”
“不对啊，总感觉这段话和电影的主题有联系。”
.......
之后，墨菲斯和安妮找到法国人，从他手里把尼奥带回了现实世界。
到了现在，黑客帝国全篇故事已经进入白热化阶段了。
雨果扮演的史密斯几乎把矩阵内所有人都复制成了自己，其中，还包括了先知。并且，史密斯还通过占据先知的身体，获得了她预知未来的能力。
当然，这并不是说所有人就死亡了，只不过就像给成一个程序弄一个外壳一样，现在史密斯就是那个外壳。
现在，史密斯几乎成为了终极大BOSS，在矩阵内拥有了毁天灭地的能力。
并且，一旦矩阵被他攻破，他还能借此入侵到现实世界中，到时候，整个机器人王国都将被他侵占。
人类，也将被他摧毁地连渣渣都不剩。
这些是矩阵内，而矩阵外的真实世界中，机器人大军履行着自己第六次摧毁锡安的职责，已经攻打到了锡安的大门口。
人类的飞船，战斗机甲军队，也都严阵以待。
大战，一触即发。
而此刻的主角却是在飞船内遇到了麻烦..
…。。